Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms