Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms