Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms