Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Sf3b2Q3UJB0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sf3b2Q3UJB0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sf3b2Q3UJB0 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sf3b2Q3UJB0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sf3b2Q3UJB0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sf3b2Q3UJB0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sf3b2Q3UJB0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sf3b2Q3UJB0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sf3b2Q3UJB0 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sf3b2Q3UJB0 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Sf3b2Q3UJB0 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sf3b2Q3UJB0 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Sf3b2Q3UJB0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sf3b2Q3UJB0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sf3b2Q3UJB0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sf3b2Q3UJB0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms