Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms