Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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