Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U6N9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U6N9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U6N9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U6N9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U6N9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U6N9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U6N9 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U6N9 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U6N9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U6N9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U6N9 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U6N9 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U6N9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U6N9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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