Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4dQ3U2K5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms