Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms