Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Palb2Q3U0P1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms