Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Hace1Q3U0D9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms