Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSG4

Alkbh5, RNA demethylase ALKBH5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh5Q3TSG4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Alkbh5Q3TSG4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Alkbh5Q3TSG4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Alkbh5Q3TSG4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Alkbh5Q3TSG4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Alkbh5Q3TSG4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Alkbh5Q3TSG4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Alkbh5Q3TSG4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Alkbh5Q3TSG4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Alkbh5Q3TSG4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Alkbh5Q3TSG4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh5Q3TSG4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms