Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim43aQ3TL54 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms