Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms