Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms