Protein–RNA interactions for Protein: Q2MDF8

Rhox4f, MCG113261, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox4fQ2MDF8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rhox4fQ2MDF8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rhox4fQ2MDF8 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rhox4fQ2MDF8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rhox4fQ2MDF8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rhox4fQ2MDF8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rhox4fQ2MDF8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rhox4fQ2MDF8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rhox4fQ2MDF8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rhox4fQ2MDF8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Rhox4fQ2MDF8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Rhox4fQ2MDF8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Rhox4fQ2MDF8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhox4fQ2MDF8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms