Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms