Protein–RNA interactions for Protein: Q1HCM0

Fgfbp3, Fibroblast growth factor-binding protein 3, mousemouse

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Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfbp3Q1HCM0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Fgfbp3Q1HCM0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fgfbp3Q1HCM0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms