Protein–RNA interactions for Protein: Q149C3

Lingo4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain containing-NOGO receptor-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo4Q149C3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Lingo4Q149C3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Lingo4Q149C3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Lingo4Q149C3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Lingo4Q149C3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms