Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp2b3Q0VF55 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms