Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rundc1Q0VDN7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms