Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps8Q0P5W1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vps8Q0P5W1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms