Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata18Q0P557 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms