Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ubxn2bQ0KL01 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms