Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms