Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnma1Q08460 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms