Protein–RNA interactions for Protein: Q08297

Rad51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51Q08297 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad51Q08297 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad51Q08297 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad51Q08297 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad51Q08297 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad51Q08297 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad51Q08297 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad51Q08297 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad51Q08297 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad51Q08297 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad51Q08297 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad51Q08297 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad51Q08297 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad51Q08297 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad51Q08297 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad51Q08297 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad51Q08297 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad51Q08297 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad51Q08297 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad51Q08297 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad51Q08297 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad51Q08297 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad51Q08297 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad51Q08297 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad51Q08297 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad51Q08297 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad51Q08297 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rad51Q08297 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rad51Q08297 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rad51Q08297 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rad51Q08297 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rad51Q08297 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51Q08297 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51Q08297 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51Q08297 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51Q08297 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51Q08297 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51Q08297 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51Q08297 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51Q08297 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51Q08297 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51Q08297 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rad51Q08297 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rad51Q08297 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51Q08297 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rad51Q08297 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51Q08297 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51Q08297 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51Q08297 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51Q08297 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51Q08297 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51Q08297 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51Q08297 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51Q08297 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51Q08297 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51Q08297 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51Q08297 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51Q08297 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51Q08297 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51Q08297 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51Q08297 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51Q08297 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51Q08297 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51Q08297 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51Q08297 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51Q08297 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51Q08297 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51Q08297 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51Q08297 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51Q08297 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51Q08297 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51Q08297 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51Q08297 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51Q08297 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51Q08297 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rad51Q08297 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rad51Q08297 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51Q08297 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51Q08297 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51Q08297 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51Q08297 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rad51Q08297 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51Q08297 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51Q08297 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51Q08297 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51Q08297 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51Q08297 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51Q08297 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51Q08297 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51Q08297 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51Q08297 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rad51Q08297 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51Q08297 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51Q08297 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51Q08297 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51Q08297 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51Q08297 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad51Q08297 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad51Q08297 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad51Q08297 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms