Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms