Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ebf1Q07802 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf1Q07802 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms