Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms