Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms