Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col9a1Q05722 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col9a1Q05722 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a1Q05722 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a1Q05722 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a1Q05722 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a1Q05722 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Col9a1Q05722 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a1Q05722 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a1Q05722 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a1Q05722 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms