Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdk18Q04899 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms