Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox13Q04891 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms