Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms