Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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