Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnd1Q03719 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms