Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms