Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Crisp3Q03402 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms