Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ddr1Q03146 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms