Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a2Q02788 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms