Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NfiaQ02780 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms