Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GscQ02591 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GscQ02591 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GscQ02591 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GscQ02591 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GscQ02591 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GscQ02591 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GscQ02591 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GscQ02591 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GscQ02591 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GscQ02591 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GscQ02591 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GscQ02591 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GscQ02591 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GscQ02591 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GscQ02591 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GscQ02591 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GscQ02591 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GscQ02591 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GscQ02591 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GscQ02591 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GscQ02591 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GscQ02591 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GscQ02591 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GscQ02591 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GscQ02591 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GscQ02591 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GscQ02591 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GscQ02591 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GscQ02591 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GscQ02591 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GscQ02591 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GscQ02591 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GscQ02591 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GscQ02591 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GscQ02591 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GscQ02591 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GscQ02591 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GscQ02591 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GscQ02591 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GscQ02591 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GscQ02591 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GscQ02591 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GscQ02591 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GscQ02591 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GscQ02591 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GscQ02591 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GscQ02591 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GscQ02591 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GscQ02591 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GscQ02591 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GscQ02591 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GscQ02591 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GscQ02591 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GscQ02591 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GscQ02591 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GscQ02591 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GscQ02591 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GscQ02591 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GscQ02591 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GscQ02591 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GscQ02591 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GscQ02591 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GscQ02591 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GscQ02591 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GscQ02591 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GscQ02591 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GscQ02591 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GscQ02591 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GscQ02591 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GscQ02591 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GscQ02591 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GscQ02591 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GscQ02591 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GscQ02591 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GscQ02591 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GscQ02591 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GscQ02591 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GscQ02591 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GscQ02591 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GscQ02591 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GscQ02591 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GscQ02591 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GscQ02591 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GscQ02591 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GscQ02591 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GscQ02591 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GscQ02591 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GscQ02591 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GscQ02591 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GscQ02591 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GscQ02591 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GscQ02591 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GscQ02591 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GscQ02591 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GscQ02591 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GscQ02591 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GscQ02591 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GscQ02591 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GscQ02591 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms