Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms