Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ascl1Q02067 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms