Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gbp1Q01514 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp1Q01514 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms