Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HmgcrQ01237 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms