Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja5Q01231 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms