Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Grin2bQ01097 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grin2bQ01097 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms