Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms